九十九里教会は、ヘボン式ローマ字でお馴染みの、ヘボン宣教師によって、1887年(明治20年)に建てられた、千葉県で、二番目に古い教会です。
ヘボンは、九十九里教会の創立期である明治17年、応援伝導のため松尾の地を訪れました。木造かわらぶき切妻屋根の教会堂の創建にあたって、ヘボンは寄付金総額の三分の一にあたる200円を投じました。
それだけではなくヘボンは自ら設計図を引き、直接教会建設の指揮をとったのです。教会堂の屋根は当時としては急勾配で、かわら職人がこわごわ作業にあたり、また室内には柱を1本も使わないなどの指示に辟易し、棟梁が3人も替わったそうです。

当時は洋式建築は珍しく、「柱のない建物」といわれ、近所の人たちがわざわざ見物に来たほどです。当時は松尾の地域までも広く「九十九里」と呼ばれていたので、新しい教会も九十九里教会と名付けられました。
明治17年までに設立された県内の教会は五つありますが、九十九里教会はその内の現存する唯一の教会です。現在の教会堂は床板や壁は改修されていますが、長椅子などは当時のままです。建物そのものもまだしっかりしています。